表位预测法获取抗原多肽方法是指特定 Th 细胞表位多肽的氨基酸组成有其特定的规律，因此可以采用计算机预测的方法获取抗原多肽。
表位预测法获取抗原多肽方法的基本原理是指特定 Th 细胞表位多肽的氨基酸组成有其特定的规律, 因此可以采用计算机预测的方法获取抗原多肽。
例如，HLA-DR1 限制性 Th 细胞表位基序的特点是：多肽的第 1 位氨基酸残基为芳香族氨基酸或疏水性氨基酸，第 6 位氨基酸残基为不带电荷的氨基酸，而第 9 位氨基酸残基则为相对疏水的氨基酸。
目前的 Th 细胞表位预测多采用网上的表位预测程序，如「TEPITOPE」（网址：http：//www.imtech.res.in/raghava/propred/）和 「SYFPEITHI」（网址：http：//www.syfpeithi.de/Scripts/ MHCServer.dll/EpitopePrediction.htm）。表位预测后， 从预测结果中选择评分最 高的一些多肽，经合成、纯化、鉴定后，用于后续鉴定研究。
表位预测法获取抗原多肽方法的基本过程可分为如下几步：
（1）打开网页；
（2）选择 MHC 分子、所需预测的表位多肽的氨基酸残基个数；
（3）输入抗原的氨基酸序列；
（4）点击「submit」或「run」获得预测结果。
（5）从预测结果中选择排位靠前的一些多肽，经合成、纯化、鉴定后，用于后续鉴定研究。
